基因计算的无服务化API
AGS 加速服务,无需搭建集群,开箱即用的AGS 加速API。提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算任务WGS,WES,RNA等多种加速任务,无需购买和持有资源,以Pay As You Go模式来调用加速能力。
工作流生命周期管理
AGS工作流,以容器平台为基础的生物信息工作流服务,提供控制台界面帮助用户管理工作流,可查看工作流状态和事件、日志等信息,提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算工作流以及工作流生命周期管理。
基因计算服务是阿里云基于容器Kubernetes技术面向生物行业用户提供的基因大数据计算服务,具有高效、弹性、可靠的优点,相比传统的基因计算过程速度更快,成本更低。
基因计算的无服务化API
AGS 加速服务,无需搭建集群,开箱即用的AGS 加速API。提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算任务WGS,WES,RNA等多种加速任务,无需购买和持有资源,以Pay As You Go模式来调用加速能力。
工作流生命周期管理
AGS工作流,以容器平台为基础的生物信息工作流服务,提供控制台界面帮助用户管理工作流,可查看工作流状态和事件、日志等信息,提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算工作流以及工作流生命周期管理。
人类全基因组测序
人类外显子基因测序业务
人类基因组比对业务
宏基因组比对业务
人类肿瘤变异检测业务
全基因组数据分析
WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程BWA/GATK可加速120倍,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2~4倍。 通过分析个体基因序列的突变机制,可为遗传病检测、肿瘤筛查等提供有力支撑,未来将在临床医学和基因诊断方面发挥巨大作用。人类全基因组有约30亿个碱基对,一个30X的WGS测序数据量大约在100GB。AGS在计算速度、精准度、成本、易用性、与上游测序仪的整合度上具有极大优势,同时适用于DNA的SNP/INDEL以及CNV结构变异检测,以及DNA/RNA病毒检测等场景。
企业在人类全基因组测序(WGS)等业务中,一般在线下IDC中完成。线下IDC资源扩容慢,无法应付业务的弹性,而且通常一个工作流需要用时30~40小时。容器服务基因计算以按需的方式提供计算资源,以高效的方式解决资源弹性问题,同时大幅提升计算效率,用时只需通常的1/30到1/120。
全基因组数据分析
WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程BWA/GATK可加速120倍,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2~4倍。 通过分析个体基因序列的突变机制,可为遗传病检测、肿瘤筛查等提供有力支撑,未来将在临床医学和基因诊断方面发挥巨大作用。人类全基因组有约30亿个碱基对,一个30X的WGS测序数据量大约在100GB。AGS在计算速度、精准度、成本、易用性、与上游测序仪的整合度上具有极大优势,同时适用于DNA的SNP/INDEL以及CNV结构变异检测,以及DNA/RNA病毒检测等场景。