科研绘图丨使用R语言Pheatmap包快速绘制基因表达量热图的方法,支持聚类和配色自定义修改
Pheatmap绘制基因表达量热图论文中展示基因表达量变化通常使用热图,今天分享一个快速绘制不同基因在各处理下表达量变化的方法,使用R语言中pheatmap包,它可以用于可视化数据集中的数值,以便更好地理解数据之间的关系和模式。创建环境与示例数据加载R包library(tibble) library(tidyverse) library(pheatmap)生成随机数据# 设置随机数种子以确保结果....

跟着Nature Biotechnology学作图:R语言ComplexHeatmap包做热图展示TCGA-BRCA数据集概况
论文Removing unwanted variation from large-scale RNA sequencing data with PRPShttps://www.nature.com/articles/s41587-022-01440-w#data-availability数据链接https://zenodo.org/record/6459560#.Y2D2NHZBzidhttps....

R语言ComplexHeatmap包做热图:热图每隔三行分开一小段
这个是有读者在B站给我的留言问到的问题热图每隔三行分开一小段 怎么实现?我最开始的想法是用ggplot2来做,将数据拆分,每三行数据做一个图,最后采取拼图的方式来实现。后来想起来R语言里有一个做热图功能非常强大的R包ComplexHeatmap应该能够实现这个目的,所以查了一下这个R包的帮助文档,找到了实现办法。参考文档链接https://jokergoo.github.io/ComplexHe....

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