文章 2024-05-06 来自:开发者社区

R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码2

R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码1:https://developer.aliyun.com/article/1501241 可视化 许多组学可视化使用R基础绘图函数。我们大部分时间都避免使用基础绘图。但是,利用手头的数据,使用这些绘图函数得到一些结果是相当简单的。 现在,让我们制作视图以快速检查RNA-se...

R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码2
文章 2024-05-06 来自:开发者社区

R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码1

在乳腺发育过程中,促生存基因Mcl1被认为是关键的调控因子之一。为了更全面地揭示Mcl1在乳腺发育中的调控作用,本研究帮助客户采用层次聚类和多维缩放(MDS)等方法对RNA-seq数据进行深入分析。层次聚类可以帮助我们识别不同样本之间的相似性和差异性,从而揭示乳腺发育过程中不同阶段的基因表达模式。而MDS则可以将高维的基因表达数据转化为低维空间中的点,便于我们进行可视化和模式识别。 本文...

R语言层次聚类、多维缩放MDS分类RNA测序(RNA-seq)乳腺发育基因数据可视化|附数据代码1
文章 2024-04-09 来自:开发者社区

R语言处理RNA等位基因不平衡(二)

1.前言: RNA测序技术允许研究人员在转录组水平上精细地检测基因表达,包括等位基因特异性表达的变异。通过比较来自同一基因的不同等位基因的表达量,可以揭示细胞内遗传和表观遗传调控机制的差异。本代码通过对RNA测序数据中的读数计数进行详细分析,旨在检测和量化等位基因不平衡。通过优化统计模型来估计等位基因表达的差异,研究人员可以识别出在特定生物学条件下受到调控的基因区域。 其实和DN...

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