速绘丨GO富集气泡图绘制方法，利用R语言ggplot2包快速绘制，完整脚本可重复绘图
速绘 丨 GO富集气泡图本期分享一个快速绘制GO富集结果图的方法，主要使用R语言tidyverse包，只需导入数据即可一步出图，可以自定义显示的数目、颜色、筛选参数，从此以后绘制GO富集图只需1秒。前言介绍下面是一个GO富集分析的结果数据表：ID：表示具体的GO条目Description：GO条目的...
R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（下）
PCA的实现流程使用上面创建的data_3数据来进行后续操作。首先生成表达矩阵，包含3个基因在200个样本中的表达情况。> kable(headTail(data_3),booktabs=T,caption = "Expression 3Gene in 200 samples") Table:...
R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（上）
学习笔记的主要内容是在R语言中利用ggplot2进行PCA分析和绘图，包括简单分析与操作流程，对比不同方式得到的结果差异，提供脚本代码供练习（下载链接见文末）PCA分析的原理在处理基因差异表达数据时，有时候需要分析其中因素的影响最大，判断结果的关系，这个时候可以用PCA分析法ÿ...
R语言数据可视化-气泡图
一、概述气泡图（Bubble Chart）是一种展示三个或更多变量之间关系的二维图表。它与散点图类似，但是在每个数据点处加上了一个圆圈，圆圈的大小和第三个变量相关。因此气泡图不仅可以用于显示两个变量之间的关系，还可以同时显示第三个变量的大小或重要性，增加了数据展示的可读性和信息量。二、数据集下面我将...
跟着NatureMetabolism学作图：R语言ggplot2转录组差异表达火山图
论文Independent phenotypic plasticity axes define distinct obesity sub-typeshttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00629-2#Sec15s42255-022-00629-2.p...
看世界杯也能学画图：R语言ggplot2画热图展示不同国家历届足球世界杯的成绩
在twitter上看见有人分享了一个图热图展示不同国家历届足球世界杯的成绩，非常有意思，时间跨度是1982年到2018年，入选国家的标准是最少参加过四次世界杯，我们今天来重复一下这个图，自己这个伪球迷也来了解一下足球世界杯的相关知识。推特上这个图还没有分享示例数据和代码，我们手动把数据整理下来，代码...
跟着Molecular Plant学作图：R语言circlize包画圈图展示基因组的一些特征补充添加图例
论文A telomere-to-telomere gap-free reference genome of watermelon and its mutation library provide important resources for gene discovery and breedingh...
跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2堆积柱形图组合哑铃图
论文A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fisheshttps://www.nature.com/articles/s41467-023-36501-4s41467-023-36501-4.pdf论文中对应的图实现的代码都有...
跟着PNAS学作图：R语言ggplot2花瓣图展示泛基因组分析中核心和可变基因
论文Evolutionary history and pan-genome dynamics of strawberry (Fragaria spp.)https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2105431118草莓PNAS.pdf今天的推文我们复现一下...
答读者问：关于R语言ggplot2做花瓣图的几个问题
有读者在公众号留言问到之前在公众号分享的R语言ggplot做花瓣图的代码相关问题，首先非常感谢这位读者能够这么认真的看我分享的内容，今天的推文主要回答一下这几个问题先回答第二个问题df1模拟生成中，1:18, 10, 180这些是怎么决定的呢？是应为df里面分组数量决定的吗？总是用180除以分组数量...
更新时间 2023-08-25 22:07:31
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