R语言对股票风险“溃疡指数”( Ulcer Index)曲面图可视化
目标函数的平滑度对于优化的成功至关重要。 可视化目标函数是一种检查平滑度的简便方法。 例如,让我们检查“溃疡指数”( Ulcer Index) ,这是一种风险度量,类似于“标准偏差”。 溃疡指数尝试通过衡量价格回撤来衡量持有交易或投资的压力。溃疡指数基于下降波动性有害、上升拨动性有利的概念。 不像金融行业通常用来衡量股票风险的标准差那样使用...
r语言绘制动态统计图:绘制世界各国的人均GDP,出生时的预期寿命和人口气泡图动画动态gif图
使用的数据 nations.csv 第3周及以后使用的来自世界银行指标门户的数据。 warming.csv 有关1880年至2017年全球年平均温度 。 year value 全球平均温度,与1900-2000年的平均温度相比。 simulations.csv美国国家航空航天局(NASA)对历史温...
R语言动态图可视化:如何、创建具有精美动画的图
演示数据集 library(gapminder) head(gapminder) ## # A tibble: 6 x 6 ## country continent year lifeExp pop gdpPercap ## <fct>...
R语言中绘制箱形图的替代品:蜂群图和小提琴图
箱形图 非常有用,因为它们不仅指示中间值,而且还显示了第一四分位数和第三四分位数的测量结果变化。但是,也有一些图提供了一些附加信息。在这里,我们将仔细研究箱形图的潜在替代方案:蜂群图和小提琴图。 蜂群图 原则上,蜂群图类似于一维散点图,因为它将单个测量结果显示为点。但是,不同之处在于,蜂群图采用了一种逻辑,以确保所绘制的点彼此靠近且不会重叠。 ...
R语言Ternary包绘制三元图、RGB三色空间分布图的方法
本文介绍基于R语言中的Ternary包,绘制三元图(Ternary Plot)的详细方法;其中,我们就以RGB三色分布图为例来具体介绍。 三元图可以从三个不同的角度反应数据的特征,因此在很多领域都得以广泛应用;如下图所示,就是一个最简单的三元图。其中,基于R语言中的Ternary包,我们可以非常方便地绘制三元图;本文就对其具体绘制方法加以介绍。 首先,由于我们需要用到R语言中的Terna....
r语言数据分析画数据相关性图热力图
要在R中画数据相关性热力图,可以使用corrplot包。以下是一个简单的示例:假设我们有一个数据集df,包含多个变量,并且想要探索它们之间的相关性。首先,需要计算变量之间的相关系数矩阵,可以使用cor函数:corr_matrix <- cor(df)接下来,使用corrplot包中的corrplot()函数来绘制热力图:library(corrplot) corrplot(corr_mat....
速绘丨GO富集气泡图绘制方法,利用R语言ggplot2包快速绘制,完整脚本可重复绘图
速绘 丨 GO富集气泡图本期分享一个快速绘制GO富集结果图的方法,主要使用R语言tidyverse包,只需导入数据即可一步出图,可以自定义显示的数目、颜色、筛选参数,从此以后绘制GO富集图只需1秒。前言介绍下面是一个GO富集分析的结果数据表:ID:表示具体的GO条目Description:GO条目的描述RatioF:分子是富集到这个GO条目上的gene的数目, 分母是所有输入的做富集分析的gen....
R语言中如何进行PCA分析?利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图(下)
PCA的实现流程使用上面创建的data_3数据来进行后续操作。首先生成表达矩阵,包含3个基因在200个样本中的表达情况。> kable(headTail(data_3),booktabs=T,caption = "Expression 3Gene in 200 samples") Table: Expression 3Gene in 200 samples | |Ge_1 |Ge...
R语言中如何进行PCA分析?利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图(上)
学习笔记的主要内容是在R语言中利用ggplot2进行PCA分析和绘图,包括简单分析与操作流程,对比不同方式得到的结果差异,提供脚本代码供练习(下载链接见文末)PCA分析的原理在处理基因差异表达数据时,有时候需要分析其中因素的影响最大,判断结果的关系,这个时候可以用PCA分析法,之前发过一篇PCA分析的简介和数学原理解析,如果有兴趣点击这里查看,今天的笔记主要围绕实际操作过程进行分享。笔者学习时参....
R语言数据可视化-气泡图
一、概述气泡图(Bubble Chart)是一种展示三个或更多变量之间关系的二维图表。它与散点图类似,但是在每个数据点处加上了一个圆圈,圆圈的大小和第三个变量相关。因此气泡图不仅可以用于显示两个变量之间的关系,还可以同时显示第三个变量的大小或重要性,增加了数据展示的可读性和信息量。二、数据集下面我将以R语言自带的mtcars数据集为例画出气泡图。首先,我们需要加载ggplot2包和mtcars数....
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