r语言机器学习逻辑回归代码实战 结果分析和折线图
以下是一些常用的R语言机器学习基本包库：caret：Classification And Regression Training（分类和回归训练），是一个非常全面的R语言机器学习包，提供了许多模型和功能，包括数据预处理、模型训练和评估、特征选择等。mlr：Machine Learnin...
R语言之数值型描述分析
文章和代码已经归档至【Github仓库：https://github.com/timerring/dive-into-AI 】或者公众号【AIShareLab】回复 R语言 也可获取。 在分析之前，先将数据集 birthwt 中的分类变量 low、race、smoke、ht 和 ui 转换成因子。 ...
生物学经典Blast序列比对算法原理，如何在R语言和Python中实现序列的比对分析？
Blast比对算法原理与实现方式做生物的同学肯定听说过blast比对这个方法，一般在NCBI等网站上可以在线进行比对，也可以在本地服务器进行比对，那么blast算法究竟是怎么实现对不同序列的比对呢？本文分享经典blast算法的基础原理，以及通过R语言和Python实现这个算法，不依赖网站自己进行序列...
R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（下）
PCA的实现流程使用上面创建的data_3数据来进行后续操作。首先生成表达矩阵，包含3个基因在200个样本中的表达情况。> kable(headTail(data_3),booktabs=T,caption = "Expression 3Gene in 200 samples") Table:...
R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（上）
学习笔记的主要内容是在R语言中利用ggplot2进行PCA分析和绘图，包括简单分析与操作流程，对比不同方式得到的结果差异，提供脚本代码供练习（下载链接见文末）PCA分析的原理在处理基因差异表达数据时，有时候需要分析其中因素的影响最大，判断结果的关系，这个时候可以用PCA分析法ÿ...
使用R语言绘制富集条形图，轻松分析基因表达数据
一、引言富集分析（enrichment analysis）是一种生物信息学方法，它可以帮助我们识别基因或其他的生物实体在某个特定的类别中过度表示的趋势。通俗来说，富集分析通过将基因分类到特定的集合中，然后根据基因在集合中的分布和总体分布的比较，来寻找哪些集合与特定的生物过程、疾病或其他功能相关联。其...
还在为浏览量焦虑吗？为何不用R语言来做归因分析找出痛点
一、引言大家好，我是一名博客作者，同时也是一个有着浏览量焦虑症的患者。每次发一篇新的博客文章，我总是不停地刷新页面，看看有多少人来访问、阅读和留言。当发现访问量不如自己预期时，我就会有一种被冷落、被忽视的感觉，弄得自己心情郁闷不已。但是，我相信我并不是唯一一个有着浏览量焦虑的博客作者。事实上...
钟南山院士的最新预测二阳来袭，如何用R语言和SEIRS模型分析新冠疫情中国趋势？
一、引言随着时间的推移，新冠病毒的二次感染人群越来越多，这意味着在春节过后暂时消失的病毒又有可能卷土重来。目前，我国主流的病毒株为XBB，中疾控中心的数据显示，自五月上旬到五月中旬，本土病例中XBB的占比已经从83.6%增加到91.9%。近期医院发热门诊人数增多的情况也表明第二波疫情可能已经到来。钟...
如何用R语言分析COVID-19相关数据
一、概述COVID-19是当前全球面临的一项重大挑战。 本文将介绍如何使用R语言分析COVID-19相关数据，探索其感染率、死亡率和人口特征的相关性，以及使用统计建模方法预测COVID-19的死亡率。二、数据导入与筛选COVID-19 Data Repository by the Center fo...
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