r语言数据分析画数据相关性图热力图
要在R中画数据相关性热力图，可以使用corrplot包。以下是一个简单的示例：假设我们有一个数据集df，包含多个变量，并且想要探索它们之间的相关性。首先，需要计算变量之间的相关系数矩阵，可以使用cor函数：corr_matrix <- cor(df)接下来，使用corrplot包...
VET：一个基于R语言的VCF数据提取工具，支持按基因ID、物理位置、样品名称提取指定变异信息
VET：Vcf Export Tools工具简介VET是一个基于R语言开发的变异位点信息批量提取工具，主要功能是根据VCF数据集，按照基因ID、样品ID、变异位点ID等参数，实现批量提取，同时支持变异位点结构注释，一步搞定变异数据的快速提取。########## WelCome to VCF Exp...
R语言中实现多维数据交并补集合运算，利用tidyverse系列包，intersect、union、setdiff
R语言集合操作数据分析时可能会遇到这样的问题：我有两个样本，分别得到了各自中关键基因，现在想找出两者共有的关键信息或者两者之间差异的部分，如果有成千上万个怎么实现呢？我有两个表格，想找出里面重复出现的行和只在第二个表出现的行，如何实现表格的交并补集合操作呢？本篇笔记简述tidyvers...
R语言笔记丨数据的创建和转换
今天的笔记内容是R语言中数据创建、随机自动生成、查看、转化相关基础知识。包括cbind、rbind、rnorm、runif、rep、dim、apply、str等的用法。R语言数据处理基础笔记创建数据正态分布随机正态分布数据可以用rnorm函数生成，下面生成8个随机数值，平均值为1，标准差为2>...
R语言笔记丨数据的合并、拆分、整合
今天学习R语言中数据重塑相关基础知识，主要有merge、melt、cast函数用法示例。合并数据框merge（）函数能够以一列为参考合并两个不同数据框，相当于数学中的布尔运算“交集、并集、反补集”，没有的元素定为NA，语法格式如下：merge(x, y, #数据框 by = interse...
探索UCI心脏病数据：利用R语言和h2o深度学习构建预测模型
一、引言心脏病是全球范围内的主要健康问题之一，对人类健康和生活质量造成了严重影响。随着医学研究和技术的不断发展，利用机器学习和深度学习等数据分析技术来预测心脏病的风险已经成为一种新的研究方向。本文的研究目的是基于UCI心脏病数据集[1]，利用R语言和h2o深度学习框架构建一个预测模型，旨在准确预测个...
使用R语言绘制富集条形图，轻松分析基因表达数据
一、引言富集分析（enrichment analysis）是一种生物信息学方法，它可以帮助我们识别基因或其他的生物实体在某个特定的类别中过度表示的趋势。通俗来说，富集分析通过将基因分类到特定的集合中，然后根据基因在集合中的分布和总体分布的比较，来寻找哪些集合与特定的生物过程、疾病或其他功能相关联。其...
数据清洗、数据处理入门！R语言我来了，数据不再零散！
一、引言「数据清洗」和「预处理」是数据科学中必不可少的一部分，它们能够帮助我们准确地分析和预测未来趋势。如果你曾经尝试过进行分析或建模，你会发现数据往往不像我们所想象的那样干净、整洁。需要对数据进行仔细的检查、清理和处理，才能真正把数据转变成有用的信息。在「数据清洗」过程中，我们需要处理各种问题如缺...
如何用R语言分析COVID-19相关数据
一、概述COVID-19是当前全球面临的一项重大挑战。 本文将介绍如何使用R语言分析COVID-19相关数据，探索其感染率、死亡率和人口特征的相关性，以及使用统计建模方法预测COVID-19的死亡率。二、数据导入与筛选COVID-19 Data Repository by the Center fo...
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