
速绘丨GO富集气泡图绘制方法,利用R语言ggplot2包快速绘制,完整脚本可重复绘图
速绘 丨 GO富集气泡图本期分享一个快速绘制GO富集结果图的方法,主要使用R语言tidyverse包,只需导入数据即可一步出图,可以自定义显示的数目、颜色、筛选参数,从此以后绘制GO富集图只需1秒。前言介绍下面是一个GO富集分析的结果数据表:ID:表示具体的GO条目Description:GO条目的...

科研绘图丨使用R语言Pheatmap包快速绘制基因表达量热图的方法,支持聚类和配色自定义修改
Pheatmap绘制基因表达量热图论文中展示基因表达量变化通常使用热图,今天分享一个快速绘制不同基因在各处理下表达量变化的方法,使用R语言中pheatmap包,它可以用于可视化数据集中的数值,以便更好地理解数据之间的关系和模式。创建环境与示例数据加载R包library(tibble) library...

R语言如何快速安装R包?常见方法与报错解决方案汇总,适用于Windows、Mac、Linux多平台
R语言如何快速安装R包?如果把R比作是沃土的话,那么R包就是鲜花,开源共享的开发者社区提供了很多功能丰富的R包,方便使用者充分利用R语言完成工作。但是,有时候在安装R包是会遇到各种各样的报错和问题,下面进行一个总结,包括mac、windows、Linux各平台的R包管理方法,建议收藏备...

R语言中实现多维数据交并补集合运算,利用tidyverse系列包,intersect、union、setdiff
R语言集合操作数据分析时可能会遇到这样的问题:我有两个样本,分别得到了各自中关键基因,现在想找出两者共有的关键信息或者两者之间差异的部分,如果有成千上万个怎么实现呢?我有两个表格,想找出里面重复出现的行和只在第二个表出现的行,如何实现表格的交并补集合操作呢?本篇笔记简述tidyvers...

R语言之 dplyr 包
文章和代码已经归档至【Github仓库:https://github.com/timerring/dive-into-AI 】或者公众号【AIShareLab】回复 R语言 也可获取。 这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。 下面以 ...

R语言之基本包
文章和代码已经归档至【Github仓库:https://github.com/timerring/dive-into-AI 】或者公众号【AIShareLab】回复 R语言 也可获取。 用 R 基本包 在实际的数据分析中,分析者往往需要花费大量的精力在数据的准备上,将数据转换为分析所需要的形式。遗憾...
R语言- future.apply 并行包用法简介
future.apply 是一个基于future包的并行计算工具包,提供了一种简单而高效的方式来并行化 apply函数族 的操作。 并行计算:future.apply包可以将apply函数族的操作并行化,从而加速计算过程。这对于大规模数据的处理和计算非常有用。易于使用:future.apply包的语...

R语言-数据处理:dplyr包的distinct 条件去重用法
在实际数据分析中,数据框中可能存在重复的行,这些重复的行可能是由于数据采集、录入等环节出现的错误,也可能是由于数据本身的特性导致的。如果不去除这些重复行,可能会对数据分析结果产生误导,影响数据分析的准确性和可靠性。因此,有必要去除数据框中重复行的有助于保证数据的准确性和可靠性。dplyr 中的dis...

R语言-数据处理:dplyr包select 函数条件选择列向量用法
dplyr 中的 select函数是一种用于选择数据框中列的函数,它可以帮助我们快速、方便地选择需要的列进行分析。select函数同时支持一些特殊的选择方式,如使用冒号(:)选择一段连续的列,使用starts_with、ends_with、contains等函数选择包含特定字符的列,使用matche...
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