使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序

关于如何安装BWA、GATK、Samtools,请参见BWA、GATK、Samtools。下载并解压人类参考基因组、人类基因测序样本1、人类基因测序样本2。wget https://public-ehpc-package.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/lifescience/b37_human_g1k_v37.fasta ...

通过AGS排查病毒序列

基于核酸序列比对的分析方式,一旦病原体的基因组已知,通过更新数据库,就可以实现高效准确检测病原体。阿里云基因计算服务AGS提供了针对mNGS宏基因组测序数据的快速比对能力,一组肺泡采样测序的宏基因组数据3.2Gbase(22M reads),60...

金融级人脸比对方案

通过人脸识别技术传入的2张人脸图片进行比对验证,返回相似度。适合权限验证场景,建议配合金融级活体检测方案使用。产品方案说明 人脸比对方案无需通过客户端SDK采集人脸照片,支持用户传入2张人脸照片,通过人脸识别算法比对2张人脸...

管理序列

刷新当前序列对象进行一些管理操作后,刷新列表以展示最新信息。序列管理页面您可以在序列管理页面查看以下信息:基本信息:展示 序列名称 和 用户名 等信息。属性:展示属性 下一个缓冲值、增量、最小值、最大值、缓存设置、是否排序 和...

概述

人脸识别是内容检测API提供的基于人脸图片检测技术的服务的统称,具体包括人脸属性检测、人脸比对、人脸检索、活体检测功能,满足您与人脸图片检测相关的需求。本文介绍了人脸识别的功能特性和相关概念。功能特性 功能 说明 使用场景 API...

CREATE SEQUENCE

选项允许当升序序列或降序序列分别达到 maxvalue 或 minvalue 时,序列回绕。如果达到限制值,则生成的下一个数字将分别为 minvalue 或 maxvalue。如果省略 CYCLE(默认值),则在序列达到其最大值后, NEXTVAL 的任何调用将返回错误。请...

创建与使用序列

当升序序列和降序序列达到各自的最大值和最小值,CYCLE选项允许序列返回到初始位置。如果达到了限制值,那么下一次产生的数值就是各自的最小值和最大值。如果没有使用CYCLE(这是默认设置),当序列达到最大值的时候,任何NEXTVAL的调用...

序列函数(NEXTVAL和CURRVAL)

在下面出的序列函数为从序列对象中获取连续的序列数提供了简单,多用户安全的方法。语法sequence.NEXTVAL sequence.CURRVAL 参数 sequence:在CREATE SEQUENCE命令中分配给序列的标识符。下面介绍了这些函数的使用方法。NEXTVAL:这个...

新建序列

设置(可选)。在该步骤需要指定以下信息:信息项说明起始于指定序列的起始值,要保证不小于属性& 最小值。增量指定序列值自增时的步长,可以为负数。最小值指定序列可获取的最小值,数据库支持的最小值为-1026。最大值指定序列可获取的...

概述

序列(Sequence)是指在数据库中按照一定规则自增的一种数字序列。因为自增所以不会出现重复的值,所以通常用来做为表的主键或唯一键。注意 连接 V2.1.0 及之后版本 OceanBase 数据库 Oracle 模式支持创建序列对象,MySQL 模式暂不支持。在...

序列帧动画

序列帧动画支持独立的样式和数据配置,包括序列帧动画的动画缩放倍数、高度偏移和序列帧合成图片等,本文介绍序列帧动画配置项的含义。在场景编辑器左侧图层列表中,单击序列帧动画图层,进入配置面板配置序列帧动画图层的样式和数据。说明...

高效基因序列检索助力新冠肺炎病毒快速分析

生物信息学中用K-mers来分析氨基酸序列,k-mer是指将核酸序列分成包含k个碱基的字符串,即从一段连续的核酸序列中迭代选取长度为K个碱基的序列,若核酸序列长度为L,k-mer长度为K,那么可以得到L-K+1个k-mers。例如下图所示,假设某序列...

ALTER SEQUENCE

更改序列生成器的定义。语法ALTER SEQUENCE name[INCREMENT BY increment][MINVALUE minvalue][MAXVALUE maxvalue][CACHE cache|NOCACHE][CYCLE]说明 ALTER SEQUENCE 可更改现有序列生成器的参数。ALTER SEQUENCE 命令中未特别设置的任何...

如何使用序列创建序列时,需要明确其初始值和步长。第一次引用 NEXTVAL 将返回序列的初始值,后续 NEXTVAL 的引用将按照上一次序列的返回值加上序列定义的步长后返回一个新值。任何时候 CURRVAL 的引用,都将返回当前序列的值,即...

案例:阿里云提供高效基因序列检索助力冠状病毒序列...

总结来说,向量抽取的具体做法主要分成三步:首先,我们要先解决如何在氨基酸序列中定义出一个一个的词出来,生物信息学中用K-mers[3]来分析氨基酸序列。k-mer是指将核酸序列分成包含k个碱基的字符串,即从一段连续的核酸序列中迭代地选取...

DBA_SEQUENCES

DBA_SEQUENCES 视图提供所有用户定义序列的相关信息。名称 类型 说明 sequence_owner TEXT 序列所有者的用户名。schema_name TEXT 序列所在 schema 的名称。sequence_name TEXT 序列的名称。min_value NUMERIC 服务器将分配给序列的最小值...

分布式序列问题

分布式序列是否全局唯一单库单表的分布式序列可以保证生成的序列 ID 全局唯一。分库分表的分布式序列仅保证单个分片的序列 ID 唯一,如果需要确保分库分表的分布式序列全局唯一,可以在序列 ID 中拼接分库分表位,以此保证全局唯一。分布式...

ALL_SEQUENCES

ALL_SEQUENCES 视图提供用户具有 select 或 update 特权的所有用户定义序列的相关信息。名称 类型 说明 sequence_owner TEXT 序列所有者的用户名。schema_name TEXT 序列所在 schema 的名称。sequence_name TEXT 序列的名称。min_value ...

USER_SEQUENCES

USER_SEQUENCES 视图提供属于当前用户的所有用户定义序列的信息。名称 类型 说明 schema_name TEXT 序列所在 schema 的名称。sequence_name TEXT 序列的名称。min_value NUMERIC 服务器将分配给序列的最小值。max_value NUMERIC 服务器将...

人脸比对API

人脸比对方案利用基于深度学习的人脸识别技术,比对两张照片是否是同一个人。应用场景 人脸比对方案可以帮助您实现以下业务场景: 当您已留底人脸照片,需要验证当前采集的人像是否与留底照片为同一人的情况。当您已通过二代身份证阅读器读...

日志及监控比对

本文介绍容器服务Swarm集群与Kubernetes集群的日志及监控功能的比对。日志 容器服务Swarm集群:通过标签实现日志等功能。容器服务Kubernetes集群:Kubernetes集群的日志功能,可在以下情况配置及使用。创建Kubernetes集群: 在创建...

人脸相似度比对模型

本文介绍人脸相似度比对模型的详细信息,包括模型功能、输入格式、输出格式及测试数据。模型介绍 模型采用ResNet50,详情请参见Deep Residual Learning for Image Recognition 输入格式 输入数据为JSON格式字符串,包含imagea字段和imageb...

活体人脸验证方案(活体检测方案)

活体人脸验证方案(活体检测方案)通过动作活体的方式采集终端用户的人脸照片并验证其真实性,然后与业务已留存的人脸照片进行人脸比对,验证两者是否为同一个人。简介 根据应用场景不同,活体人脸验证可分为两类能力:人脸比对 终端用户在...

Jackson框架enableDefaultTyping方法反序列化漏洞

Jackson是一套开源的java序列化与反序列化工具框架,可将java对象序列化为xml和json格式的字符串并提供对应的反序列化过程。由于其解析效率较高,Jackson目前是Spring MVC中内置使用的解析方式。近期,Jackson框架2.7.10及2.8.9以下版本...

人证合一校验

场景能力描述 通过人脸照片...SDK参考 阿里云视觉AI能力支持使用SDK调用,具体可参见SDK总览下载安装。安全声明 请确保上传的图片或文件来源符合相应的法律法规。通过体验调试上传的临时文件有效期为1小时,在24小时后会被系统自动清理删除。

解密ADB高效基因检测系统

切分成片的基因序列进行分析,得到全部基因片段的组成成分即检测结果,从而为疾病的确诊以及精准治疗提供有力支持。图 1.基因检测流程 通常在生物分析检测中进行一次病原体检测,大约生成5亿个75BP的基因片段。过滤掉属于人的基因组织...

离线活体检测SDK

离线活体SDK提供基于客户端的1:1比对能力,通过SDK接口传入一张用户照片,和当次用户做活体动作之后采集到的活体人脸进行1:1比对,返回比对分值和相应的活体照片。UI自定义 支持自定义SDK的UI功能,您可以根据实际业务进行定制。应用场景 ...

基因分析应用

以遗传病的数据分析举例,需要进行数据质控、序列比对、变异检测和变异注释等多个步骤。图1: 基因数据分析流程(来源/《中华医学遗传学杂志》)我们以工作流(Pipeline or Workflow)来指代这些分析脚本。简单的来说,它可以是一段由用户...

概述

序列分解函数 ts_decompose 使用STL算法时序数据进行序列分解。时序聚类函数 ts_density_cluster 使用密度聚类方法多条时序数据进行聚类。ts_hierarchical_cluster 使用层次聚类方法多条时序数据进行聚类。ts_similar_instance 查找...

DROP SEQUENCE

删除序列。语法 DROP SEQUENCE name[,.]说明 DROP SEQUENCE 可删除序列号生成器。要执行该命令,您必须是超级用户或序列的所有者。参数 参数 说明 name 序列的名称(可能是 schema 限定的)。示例 删除序列 serial:DROP SEQUENCE serial;

查看磁盘序列

本文介绍如何在Linux和Windows操作系统中查看磁盘序列号。使用限制 序列号特性使用限制说明:只支持2020年06月10日及之后新创建的磁盘,之前创建的磁盘不具有该特性。只支持在I/O优化实例上使用该特性。云盘均支持该特性,包括:ESSD云盘、...

商品比对模型

本文介绍商品比对模型的详细信息,包括模型功能、输入格式、输出格式及测试数据。模型介绍 该模型的Backbone采用ResNet50,集成先进的图像度量学习技术,支持鞋类、包包及裙装商品的相似比对分析。如果您需要比对指定类型的商品,请提交工...

分布式序列

数据访问代理提供了生成分布式环境下的分布式唯一序列(Sequence)的能力,该序列有全局唯一、全局递增的特性,常用于分库分表下的主键、业务主键生成的场景。注意 数据访问代理分布式序列功能是基于数据库实现,如果需要使用该功能,需要...

概述

本文将介绍容器服务swarm集群与Kubernetes集群主要功能比对的前提条件及使用限制。前提条件 您已经成功创建一个 Kubernetes 集群,参见创建 Kubernetes 集群。说明。目前容器服务Kubernetes版支持四种集群:经典集群、Kubernetes托管版、...

案例:解密阿里云高效病原体基因检测工具

(3)通过高通量基因测序仪,核酸序列进行测序。高通量测序为了保证精度,会将很长的核苷酸序列,切成小的分片,分别进行测序,在读取基因序列上,一般是50pb到200bp不等。(4)高通量测序之后,需要查询相关的病原体标准序列,找到匹配...

序列化方式选择

序列化的过程是将Java对象转成byte数组在网络中传输,反序列化会将byte数组转成Java对象。简介 序列化的选择需要考虑兼容性,性能等因素,HSF的序列化方式支持java、hessian2,默认是hessian2。序列化方式的对比和配置(只在服务端配置HSF...

LIMIT及SLIMIT子句

LIMIT和SLIMIT分别限制每个查询返回的数据点个数和序列个数。LIMIT子句LIMIT返回指定measurement中的前N个数据点。语法SELECT_clause[INTO_clause]FROM_clause[WHERE_clause][GROUP_BY_clause] [ORDER_BY_clause]LIMIT 语法描述N表示从指定...

【漏洞公告】CVE-2017-5941:Node.js反序列化远程代码...

实际上它是Google V8引擎进行了封装。V8引擎执行Javascript的速度非常快,性能非常好。Node.js一些特殊用例进行了优化,提供了替代的API,使得V8在非浏览器环境下运行效果更加优秀。Node.js存在反序列化远程代码执行漏洞。Node.js的...

隔离等级

这是因为此模式允许某些并发写入继续进行(例如,操作X和Y),即使历史记录显示Y是在X之后提交的,但结果是Y在X之前执行的(也就是说,它们之间可序列化)。要禁止这种重新排序,请将表隔离级别设置为Serializable,以使这些事务失败。...

序列化协议

SOFARPC 在使用 Bolt 通信协议的情况下,可以选择不同的序列化协议。目前支持 hessian2 和 protobuf。默认情况下,SOFARPC 使用 hessian2 作为序列化协议。如果您需要将序列化协议设置成 protobuf,需要在发布服务时进行如下设置:在 标签...
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