高效基因序列检索助力新冠肺炎病毒快速分析 - 云原生数仓 AnalyticDB MySQL

功能构建的 基因检索系统,支持毫秒级针对10亿级别的向量数据进行查询分析,更加快速、高效的为 肺炎 病毒防控、研发治疗药物以及相关疫苗提供帮助。 背景信息 ...

案例:阿里云提供高效基因序列检索助力冠状病毒序列分析 - 云原生数仓 AnalyticDB PostgreSQL

国家,造成了80多万人感染,4万多人失去了生命。到目前为止,疫情使得50多个国家停摆,全世界范围内造成了数千亿美元的经济损失。阿里云提供高效 基因序列检索助力 病毒序列分析用于疫情防治。对于当下疫情, 基因序列分析技术主要用在一下几个方面。第一,用在 状 ...

新生儿测序:开启基因测序市场的新蓝海!

技术发展成熟时,伴随着婴儿降临的 基因 数据将会陪伴着人的一生,致力于改善人类生活和助力个性化的治疗,成为 生命成长过程中的“指南针”。原文发布 时间为:2015-01-07本文来自云栖社区合作伙伴“大数据文摘”,了解相关信息可以关注“BigDataDigest”微信公众号 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:255 回复:0
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单细胞技术—基因测序新方向

领域这一 方法还可被广泛用于其他重要的生物研究领域,如组织器官内细胞 基因组的异质性研究、干细胞的异质性研究、生殖细胞的遗传重组研究、胚胎的植入前遗传学诊断研究、法医学少量DNA 等。如下为具体应用领域。1. 胚胎发育 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:383 回复:0

通过AGS处理全基因组测序WGS - 容器服务Kubernetes版

通过AGS可以快速处理全基因组 WGS(Whole Genome Sequencing)的全流程任务,包括 基因比对、排序、去重和变异 ...

基因测序、大数据分析——精准治癌正在成为现实

2006年第二代 技术出现,成本降到约1亿人民币左右,华大 完成了第一个中国人基因组 计划,当时在深圳耗资数千万人民币。“到今天为止,一个人的全 基因 试剂成本已降到1000美金以下,其分析成本则低于试剂的成本,”尹烨分析说 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 知与谁同 浏览:155 回复:0

用基因测序“治未病”

现行的政策法规,注册程序是一个无法 完成的死结。”原来,中国现在使用的 基因 诊断产品都是国外进口,而《医疗器械注册管理办法》中明文规定,境外医疗器械在国内注册需满足这一条件:“境外医疗器械已经通过境外政府医疗器械主管部门的 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:316 回复:0

节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

上传到云端进行预订的 分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了 的分析方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。存储周期长是 基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: yq传送门 浏览:3283 回复:1

基于 MaxCompute 的极速的基因测序分析

。结语或许很快,癌症患者可以当天拿到靶向药物是否有疗效的根据; 生病儿的早期诊断当天就可以排除是否遗传疾病; 基因 分析就像今天验血一样成为普通人司空见惯的体检手段。或许将来,MaxCompute 可以更加发挥计算的能力,辅助挖掘 DNA 上 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 隐林 浏览:1838 回复:0

基因测序企业如何解决存储和计算需求与有限IT基础设施的矛盾

基因 行业的数据有两大特点,单人采集的数据量较大,以及基于这个前提的大数据量的存储与计算力需求。对于企业来说数据即是无形资产,而这两点仅仅是核心要素。除此之外,由此还需要解决数据的后期增值以及为此所必须的技术支撑能力。如何提供?如何解决?这就是本文想 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 社区助手 浏览:146 回复:0

基因测序的产业链及商业模式

导读:基因组学是未来最被看好的领域之一,在农业、畜牧业、祖先起源、法医取证、生物能源、药物等领域均有广泛应用。探索 基因 行业的产业链和商业模式是目前 服务公司目前的主要工作,本文为大家梳理一下 基因 服务行业的产业链和商业模式 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:364 回复:0

节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

云端进行预订的 分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了 的分析方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。 存储周期长是 基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: yunqi_share 浏览:451 回复:0

基因测序的云计算平台可能带来的变革与进步

自二代 的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代 也带动了整个 基因研究的产业链。在二代 的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在 价格持续下降的情况下,中游 数据的生物信息学分析成为了提高效率最大 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 泡泡浅眠 浏览:124 回复:0

【Spark Summit East 2017】加速云上Spark基因测序的数据驱动方法以及案例研究

如何在云上配置Spark集群加速对于 基因序列的 工作。更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小猫吃鱼569 浏览:609 回复:0

新发布:免费的防疫数据分析与可视化平台---阿里云新冠病毒疫情分析App

免费的防疫数据分析与可视化平台能力---阿里云 病毒疫情分析App 病毒疫情分析App是基于阿里云日志服务中台,提供的一站式的数据处理可视化分析系统。借助它,可以在全球范围内了解各省份、市区的全面一手疫情信息和防疫新闻动态。目前该能力全面开放给政府、社区、第三方平台和开放者进行广泛应用。null ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 成喆 浏览:209 回复:0

新冠病毒破解有了巨大突破,达摩院做了什么?

;在 病毒序列拼接阶段使用分布式设计的de Bruijn图算法,变异 病毒也能精准检测。浙江省疾控中心 基因 负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院 算法可以为 病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短 时间内将检测范围覆盖整个 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1947222060680488 浏览:23 回复:0

新冠病毒破解有了巨大突破,达摩院做了什么?

拼接阶段使用分布式设计的de Bruijn图算法,变异 病毒也能精准检测。浙江省疾控中心 基因 负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院 算法可以为 病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短 时间内将检测范围覆盖整个确诊病例 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 祥栖 浏览:196 回复:0

新冠病毒的演化的进化算法推演

的发展就一直牵动着全国人民的心。但随着近两个月疫情的飞速发展,可以说 病毒的传播速度已经超出了所有人的预料!而年前因工作需要,刚研究过进化算法,所以 病毒是如何快速进化出来的,引起了我的兴趣。1. 基因总量从网上的公开数据可以查到, 病毒基因 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 夜半饿得慌 浏览:80 回复:0

个人全基因组测序分析全过程24小时内完成,人类离这个梦想又近了

随着运行在阿里云上的BGI Onlinebeta 版本上线,人类距离24小时 完成一个人全基因组 和分析的梦想又迈出了坚实的一步。日前,华大 基因宣布其在阿里云计算平台部署的服务产品BGI Online国内beta版本正式上线,堪称 基因行业的&ldquo ...
来自: 开发者社区 > 论坛 作者: sheeta 浏览:5087 回复:0

新冠病毒肺炎疫情数据分析 APP 发布 国际疫情大盘

SLS 发布针对 病毒肺炎疫情国内动态展示分析的 APP 已经全面开放给政府、社区、第三方平台和开放者进行广泛应用,完全免费开放。随着 病毒肺炎疫情在全球爆发,又推出跟踪关注全球范围疫情动态的分析大盘。简介在今年2月初,SLS 已经发布针对 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1380695215722836 浏览:69 回复:0

为什么分区消费时间相差较大、滞后明显或乱序? - 消息队列Kafka版

Group页签,单击查看消息堆积,显示某分区的最近消费 时间比其他分区早,说明分区先收到来自Producer的消息 ...

压测完成后 VUM 如何计算?如何关联各 API 的并发? - 性能测试 PTS

。 VUM 全称 Virtual User Minute,意为“虚拟用户× 时间”。1 个虚拟用户执行 1 分钟压 则消耗 1 个 VUM ...

解锁新姿势:仅花9.9RMB就能利用PTS铂金版完成压测?

时长,按分钟粒度,不满一分钟按一分钟计算),举例:100并发用户运行10分钟即1000VUM, 1并发用户运行1000分钟也是1000VUM,以此类推。比较贴心的是PTS铂金版并不是同大部分SaaS压 产品那样基于压 时间预设的最高并发计算VUM,而是按照 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 中间件小哥 浏览:535 回复:0

域名过期已完成续费,多长时间可恢复解析? - 云解析 DNS

如果您的域名已过期,过期后进行续费,一般续费成功后需要24-48小时可恢复使用,期间无加速生效的方法,建议您在域名过期前 完成续费。具体见以下场景:说明 无论以下何种场景,域名过期后,DNS ...

译文——2019年中国新型冠状病毒国内外传播的初步风险分析

联系原作者方式: Shengjie.Lai@soton.ac.uk; A.J.Tatem@soton.ac.uk# 2 正文翻译截止至北京 时间2020年1月25日,中国报告确诊2019新型 病毒(2019-nCoV)感染确诊病例1409人,疑似 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 胖胖雕 浏览:13 回复:0

病毒盗窃了黑寡妇的制毒基因

名叫WO的 病毒被发现盗窃了毒蜘蛛黑寡妇制造毒素的 基因编码。研究报告发表在《Nature Communications》期刊上。研究人员发现,WO携带的一些 基因跟昆虫和蜘蛛携带的 基因十分相近。研究人员猜测,WO 很可能需要借助这些 基因的力量才能渗透到动物 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 晚来风急 浏览:78 回复:0

来测一下你有没有SQL优化基因!

。 ## 越老越有SQL优化 基因[《带你走进179个SQL优化场景》](https://github.com/digoal/blog/blob/master/201706/20170601_02.md) ...
来自: 开发者社区 > 问答 作者: 德哥 浏览:7052 回复:22

请问像lpush这种命令,能保序吗?如果两边同时操作,同步需要时间,通过到对端之后如何保序呢?

请问像lpush这种命令,能保 吗?如果两边同时操作,同步需要 时间,通过到对端之后如何保 呢? ...
来自: 开发者社区 > 问答 作者: 不靠谱贝贝 浏览:9 回复:0

公测服务条款 - 新零售智能助理

服务条款( 零售智能助理 ...

火爆的背后,高通量测序面临5大挑战 | 深度

最大化改善人类健康而言,解决这些挑战是至关重要的。相关文章:基因组 进入100美元时代?PCR反应中的强大 技术:让 基因分析变得更快更便宜华大 基因董事长汪健:人类的医疗方式,已经到了改变之时打破钱学森记录的张锋: 基因编辑神器CRISPR技术的开拓者本文作者:张利本文转自雷锋网禁止二次转载,原文链接 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 行者武松 浏览:116 回复:0

苹果公司布局DNA测序

。”要参与到这些研究中,一个人必须先同意进行一项 基因测试,比如,向苹果公司认可的实验室提交一个“唾液收集包”。最初的这种实验室据说是由加州大学和Mount Sinai医院运营的顶级 基因 中心。计划中的DNA研究,将收集 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:269 回复:0

安捷伦$8000万投资下一代测序公司

,该期权将于2018年3月2日到期。“安捷伦投资于具有广阔前景的 基因 团队和技术,”安捷伦诊断和基因组学集团总裁Jacob Thaysen在一份声明中说,“安捷伦一直很明确,关于其在诊断领域继续成长、并为此构建 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 青衫无名 浏览:84 回复:0

60秒完成病毒基因对比 阿里云向社会免费开放基因计算服务

全球疫情肆虐,各大科技公司都在竭尽全力抗击疫情。 3月13日,阿里云对外宣布,将向全球一线病毒研究机构免费开放基因计算服务,医疗科研机构、疾控中心等可在云上进行病毒基因比对,只需60秒即可完成包括新冠病毒在内的任意病毒基因对比工作,对进一步了解病毒变异提供有效依据。这是继此前宣布AI算力免费后,...

60秒完成基因比对工作 阿里云免费向全球机构开放病毒检测技术

全球疫情肆虐,各大科技公司都在竭尽全力抗击疫情。 3月13日,阿里云对外宣布,将向全球医疗科研机构、疾控中心等一线病毒研究机构免费开放病毒比对服务,可大幅提升病毒基因检测效率,最快只需60秒即可完成包括新冠病毒在内的任意病毒基因对比工作,对进一步了解病毒变异提供有效依据。这是继此前宣布AI算力免...

新冠病毒破解有了巨大突破,达摩院做了什么?

​阿里巴巴达摩院正在用AI算法抗击新型冠状病毒肺炎疫情。2月1日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台。利用阿里达摩院研发的AI算法,可将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时,大幅缩短确诊时间,并能精准检测出病毒的变异情况。 达摩院算法专家顾斐博士在疾控中心基因检测分析现场 当前,...

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加速新冠疫苗研发,阿里云免费开放一切AI算力!

​新型冠状病毒感染的肺炎疫情牵动着每一个人的心。为了帮助加速新药和疫苗研发,今天我们做了一个决定: 向全球公共科研机构免费开放一切AI算力 疫情期间,任何针对本次新型冠状病毒分析、疫苗新药研发的公共科研机构、学校、医院,都可以通过邮件联系阿里云疫情公益小组。我们将在第一时间与相关机构取得联系。 联...

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解密阿里云高效病原体基因检测工具

1.背景介绍 病原体基因检测,为各种严重感染的诊断提供了基础。病原体检测流程分成五个步骤:(1)采集病人的样本,比方说静脉血,痰液,肺泡灌洗液,或者脑脊髓液等。(2)对样本进行培养,提取样本中的核酸组织。(3)通过高通量基因测序仪,对核酸序列进行测序。高通量测序为了保证精度,会将很长的核苷酸序列,...

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云上mNGS分析: 通过云服务60秒完成病毒序列比对

新型冠状病毒SARS-CoV-2 RNA在发病后数周内在上呼吸道或下呼吸道中检测到,用于泛病原体检测的基因组下一代测序(mNGS)为此次新冠病毒SARS-CoV-2 RNA 的早期发现和准确测序立下了汗马功劳。 目前针对新型冠状病毒核酸检测,是指多重荧光RT-PCR试剂盒,主要针对新冠病毒ORF...
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