【Spark Summit East 2017】加速云上Spark基因测序的数据驱动方法以及案例研究

如何在云上配置Spark集群加速对于 基因序列的 工作。更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小猫吃鱼569 浏览:609 回复:0

新生儿测序:开启基因测序市场的新蓝海!

的。Petrikin博士还举例说明:他们医院的医生曾在诊断一个血糖极低的女婴时拟采取切除女婴的整个胰腺,然而通过全基因组 发现只需要切除胰腺中的一小部分,这使患者避免了长期依赖胰岛素。 在这种情况下,假设通过 基因检测确定的疾病没有治愈 方法 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:255 回复:0

通过AGS处理全基因组测序WGS - 容器服务Kubernetes版

通过AGS可以快速处理全基因组 WGS(Whole Genome Sequencing)的全流程任务,包括 基因比对、排序、去重和变异 ...
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基因测序、大数据分析——精准治癌正在成为现实

介入是一种主动行为。”这正是闫小君在精准医疗时代的期待,受益于 基因 的“摩尔定律”,期待距离实现正越来越近。告别“一药千用”如今,影像学的诊断已能发现肿瘤,随后选择不同治疗 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 知与谁同 浏览:155 回复:0

用基因测序“治未病”

在中国两部委(食品药品监督管理局、国家卫生计生委)用一纸禁令将 基因 打入“冷宫”仅两个月,世界最大的 基因 仪器制造商Illumina的掌门人Jay Flatley先生就急冲冲跑来中国,并高调表示:“我十分看好中国 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:316 回复:0

单细胞技术—基因测序新方向

领域这一新 方法还可被广泛用于其他重要的生物研究领域,如组织器官内细胞 基因组的异质性研究、干细胞的异质性研究、生殖细胞的遗传重组研究、胚胎的植入前遗传学诊断研究、法医学少量DNA 等。如下为具体应用领域。1. 胚胎发育 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:383 回复:0

基于 MaxCompute 的极速的基因测序分析

),每个位置上的碱基可能是 ATCG 中的一个。简单理解起来,就是有了这 3Gb 长的字符串,就能克隆一个你。 基因 ,就是用化学和物理的 方法,把你身体里这 3Gb 字符串检测出来。当然,由于受当前 技术的限制,我们并不能一次性 得一个完整的 3Gb ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 隐林 浏览:1838 回复:0

基因测序企业如何解决存储和计算需求与有限IT基础设施的矛盾

,因为 基因 行业中的关键设备—— 仪始终是一个线下的设备,要想利用公有云的计算和存储资源,需要解决数据上云的难题,包括以下几方面:-文件多,传统的上云 方法性能和易用性不佳- 仪下机数据游经几种存储类型,管理和上云麻烦-现有应用 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 社区助手 浏览:146 回复:0

基因测序的产业链及商业模式

导读:基因组学是未来最被看好的领域之一,在农业、畜牧业、祖先起源、法医取证、生物能源、药物等领域均有广泛应用。探索 基因 行业的产业链和商业模式是目前 服务公司目前的主要工作,本文为大家梳理一下 基因 服务行业的产业链和商业模式 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:364 回复:0

基因测序的云计算平台可能带来的变革与进步

。如果未来疾病的发展演变成依据分子水平的变化进行分类,那么诸如GCBI等云计算平台对临床的帮助会更大。个人健康随着 技术在医疗领域的应用,市面上已经有不少针对个人健康的检测业务了,检测 方法包括个人全基因组 、定制化 基因芯片等等。而这些数据的 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 泡泡浅眠 浏览:124 回复:0

节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

上传到云端进行预订的 分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了新的分析 方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。存储周期长是 基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: yq传送门 浏览:3283 回复:1

节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

云端进行预订的 分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了新的分析 方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。 存储周期长是 基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: yunqi_share 浏览:451 回复:0

阿里云高效基因序列检索助力新冠肺炎病毒序列快速分析 - 产品与运维技术专题合集

序列进行分析。 为方便演示AnalyticDB for MySQL 基因片段检索 方法,我们从GenBank下载了大量 病毒的RNA片段,并将GenBank内部关于 病毒的论文以及Google ...

案例:阿里云提供高效基因序列检索助力冠状病毒序列分析 - 云原生数仓 AnalyticDB PostgreSQL

片段检索的 方法,我们从genbank下载了大量的 病毒RNA的片段,和genbank内部的关于 病毒的论文以及google scholar中相关 病毒的论文导入到AnalyticDB 基因检索数据库中。 基因检索的演示界面如图1,用户将冠状 病毒的序列(COVID-19 ...

高效基因序列检索助力新冠肺炎病毒快速分析 - 云原生数仓 AnalyticDB MySQL

演示AnalyticDB for MySQL 基因片段检索 方法,我们从GenBank下载了大量 病毒的RNA片段,并将GenBank内部关于 病毒的论文以及Google Scholar中相关 病毒的论文导入 ...

Linux实例被植入kdevtmpfsi挖矿病毒的处理方法

RDS日志备份等功能。如果您在阿里云平台授权或者提交过登录账号、密码等安全信息,建议您及时修改。请您参考以下步骤进行操作。注意:此方式仅为临时处理方案,由于 病毒植入场景较多,且出现该情况,很有可能操作系统或应用程序已经存在可被利用的漏洞。建议及时 ...
来自: 帮助

前序遍历,中序遍历,后序遍历二叉树 ( 递归非递归方法 )

null /** * 前 遍历递归解法: * (1)如果二叉树为空,空操作 * (2)如果二叉树不为空,访问根节点,前 遍历左子树,前 遍历右子树 */ public static ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 范大脚脚 浏览:5 回复:0

病毒盗窃了黑寡妇的制毒基因

名叫WO的 病毒被发现盗窃了毒蜘蛛黑寡妇制造毒素的 基因编码。研究报告发表在《Nature Communications》期刊上。研究人员发现,WO携带的一些 基因跟昆虫和蜘蛛携带的 基因十分相近。研究人员猜测,WO 很可能需要借助这些 基因的力量才能渗透到动物 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 晚来风急 浏览:78 回复:0

来测一下你有没有SQL优化基因!

。 ## 越老越有SQL优化 基因[《带你走进179个SQL优化场景》](https://github.com/digoal/blog/blob/master/201706/20170601_02.md) ...
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linux下使用sort命令升序、降序、随机及组合方式排序方法

;&&&&&&&& defe####################################################对于上述文件想实现这样的排序结果,先按优先级倒 排序 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 余二五 浏览:0 回复:0
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