高效基因序列检索助力新冠肺炎病毒快速分析 - 云原生数仓 AnalyticDB MySQL

功能构建的 基因检索系统,支持毫秒级针对10亿级别的向量数据进行查询分析,更加快速、高效的为 肺炎 病毒防控、研发治疗药物以及相关疫苗提供帮助。 背景信息 ...

案例:阿里云提供高效基因序列检索助力冠状病毒序列分析 - 云原生数仓 AnalyticDB PostgreSQL

万多人失去了生命。到目前为止,疫情使得50多个国家停摆,全世界范围内造成了数千亿美元的经济损失。阿里云提供高效 基因序列检索助力 病毒序列分析用于疫情防治。对于当下疫情, 基因序列分析技术主要用在一下几个方面。第一,用在 病毒的溯源和分析,可以帮助人们 ...

新生儿测序:开启基因测序市场的新蓝海!

在美国,一个叫做“BabySeq Project”(新生儿 计划)的蓝图正在启动,这项计划不仅拓展了下一代 技术的应用领域,成为 市场的 蓝海;并且让伴随着婴儿降临的 基因 数据陪伴着人的一生,致力于改善人类生活和助力个性化 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:255 回复:0
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单细胞技术—基因测序新方向

领域这一 方法还可被广泛用于其他重要的生物研究领域,如组织器官内细胞 基因组的异质性研究、干细胞的异质性研究、生殖细胞的遗传重组研究、胚胎的植入前遗传学诊断研究、法医学少量DNA 等。如下为具体应用领域。1. 胚胎发育 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:383 回复:0

通过AGS处理全基因组测序WGS - 容器服务Kubernetes版

通过AGS可以快速处理全基因组 WGS(Whole Genome Sequencing)的全流程任务,包括 基因比对、排序、去重和变异 ...

基因测序、大数据分析——精准治癌正在成为现实

阶段,分别以PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)、 基因芯片与 基因 的出现为节点。其中, 基因 完全精准分析 基因序列,准确度最高,想象力最大;而芯片分析技术,现主要适用于分析某一个特定 结果,比如诊断一个人体内有无乙肝 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 知与谁同 浏览:155 回复:0

用基因测序“治未病”

全球所知,并彻底催热了 基因 产业。2013年,朱莉在麦利亚德(300296,股吧) 基因公司接受了 基因 疾病筛查, 结果显示她携带了家族遗传的缺陷 基因,因此她有87%的可能性会罹患乳腺癌。朱莉毅然接受了双侧乳腺切除术。朱莉在给《纽约时报》的信中写到 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:316 回复:0

基于 MaxCompute 的极速的基因测序分析

。结语或许很快,癌症患者可以当天拿到靶向药物是否有疗效的根据; 生病儿的早期诊断当天就可以排除是否遗传疾病; 基因 分析就像今天验血一样成为普通人司空见惯的体检手段。或许将来,MaxCompute 可以更加发挥计算的能力,辅助挖掘 DNA 上 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 隐林 浏览:1838 回复:0

基因测序的产业链及商业模式

到资质成为能否领跑国内 服务行业的关键之一。6月30日,CFDA以罕见的速度报批了华大 基因 仪和试剂盒。疾病基因组数据库的建立:对于 服务类企业来说, 结果的解读是业务流程中最大的壁垒,数据解读的准确度和样本量直接相关,是否拥有企业 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:364 回复:0

基因测序的云计算平台可能带来的变革与进步

自二代 的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代 也带动了整个 基因研究的产业链。在二代 的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在 价格持续下降的情况下,中游 数据的生物信息学分析成为了提高效率最大 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 泡泡浅眠 浏览:124 回复:0

基因测序企业如何解决存储和计算需求与有限IT基础设施的矛盾

能力客户讲 基因数据的提取 部分仍然放在线下,将 结果数据通过CSA(混合云存储设备)上传到云端后,利用阿里云批量技术(BatchCompute)来进行 数据的大规模并行批处理作业,按实际数据量使用。这样即可保证峰谷不同数据量的数据计算力的需求。数据生命 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 社区助手 浏览:146 回复:0

节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

上传到云端进行预订的 分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了 的分析方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。存储周期长是 基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: yq传送门 浏览:3283 回复:1

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来自: 开发者社区 > 博客 作者: yunqi_share 浏览:451 回复:0

【Spark Summit East 2017】加速云上Spark基因测序的数据驱动方法以及案例研究

如何在云上配置Spark集群加速对于 基因序列的 工作。更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小猫吃鱼569 浏览:609 回复:0

新发布:免费的防疫数据分析与可视化平台---阿里云新冠病毒疫情分析App

免费的防疫数据分析与可视化平台能力---阿里云 病毒疫情分析App 病毒疫情分析App是基于阿里云日志服务中台,提供的一站式的数据处理可视化分析系统。借助它,可以在全球范围内了解各省份、市区的全面一手疫情信息和防疫新闻动态。目前该能力全面开放给政府、社区、第三方平台和开放者进行广泛应用。null ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 成喆 浏览:209 回复:0

新冠病毒的演化的进化算法推演

的发展就一直牵动着全国人民的心。但随着近两个月疫情的飞速发展,可以说 病毒的传播速度已经超出了所有人的预料!而年前因工作需要,刚研究过进化算法,所以 病毒是如何快速进化出来的,引起了我的兴趣。1. 基因总量从网上的公开数据可以查到, 病毒基因 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 夜半饿得慌 浏览:80 回复:0

新冠病毒破解有了巨大突破,达摩院做了什么?

;在 病毒序列拼接阶段使用分布式设计的de Bruijn图算法,变异 病毒也能精准检测。浙江省疾控中心 基因 负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院 算法可以为 病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短时间内将检测范围覆盖整个 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1947222060680488 浏览:23 回复:0

新冠病毒破解有了巨大突破,达摩院做了什么?

拼接阶段使用分布式设计的de Bruijn图算法,变异 病毒也能精准检测。浙江省疾控中心 基因 负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院 算法可以为 病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短时间内将检测范围覆盖整个确诊病例 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 祥栖 浏览:196 回复:0

新冠病毒肺炎疫情数据分析 APP 发布 国际疫情大盘

SLS 发布针对 病毒肺炎疫情国内动态展示分析的 APP 已经全面开放给政府、社区、第三方平台和开放者进行广泛应用,完全免费开放。随着 病毒肺炎疫情在全球爆发,又推出跟踪关注全球范围疫情动态的分析大盘。简介在今年2月初,SLS 已经发布针对 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1380695215722836 浏览:69 回复:0

4核16G 3节点与2核8G 3节点实例压测结果比较 - 阿里云Elasticsearch

规格的阿里云Elasticsearch集群的压 比较 结果。 说明 数据为官方提供的geonames,大小为3.3GB ...

公测新用户使用引导 - 可信账本数据库 LedgerDB

本文主要帮助 用户快速创建LedgerDB实例和 ...

译文——2019年中国新型冠状病毒国内外传播的初步风险分析

)Title: Preliminary risk analysis of 2019 novel coronavirus spread within and beyond China题目: 2019年中国新型 病毒国内外传播的初步风险分析。Author ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 胖胖雕 浏览:13 回复:0

病毒盗窃了黑寡妇的制毒基因

名叫WO的 病毒被发现盗窃了毒蜘蛛黑寡妇制造毒素的 基因编码。研究报告发表在《Nature Communications》期刊上。研究人员发现,WO携带的一些 基因跟昆虫和蜘蛛携带的 基因十分相近。研究人员猜测,WO 很可能需要借助这些 基因的力量才能渗透到动物 ...
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来测一下你有没有SQL优化基因!

。 ## 越老越有SQL优化 基因[《带你走进179个SQL优化场景》](https://github.com/digoal/blog/blob/master/201706/20170601_02.md) ...
来自: 开发者社区 > 问答 作者: 德哥 浏览:7052 回复:22

钉钉、微信产品大PK,基因已经决定了结果

12号的三家纸媒报纸广告,到昨天的李开复等大佬站台,钉钉3.0的此次宣传,足以见得阿里对其的重视。究其原因,萤连长觉得不外乎这2个亮点:1.社交2.开放既然有亮点,为什么又说 基因决定了 结果?1.这是阿里又一次尝试 的社交入口在微信成为 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 晚来风急 浏览:172 回复:0

火爆的背后,高通量测序面临5大挑战 | 深度

:从简单 文库构建的失败到虚假文库的产生,最终导致 结果的错误。因此,在 项目开始时正确评估每个样本的质量变得至关重要。 文库尽管,各大 平台公司花大力气在降低生成原始序列的成本上,但是在构建 库方面却不然。人类 基因 文库的构建 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 行者武松 浏览:116 回复:0

个人全基因组测序分析全过程24小时内完成,人类离这个梦想又近了

随着运行在阿里云上的BGI Onlinebeta 版本上线,人类距离24小时完成一个人全基因组 和分析的梦想又迈出了坚实的一步。日前,华大 基因宣布其在阿里云计算平台部署的服务产品BGI Online国内beta版本正式上线,堪称 基因行业的&ldquo ...
来自: 开发者社区 > 论坛 作者: sheeta 浏览:5087 回复:0

苹果公司布局DNA测序

。”要参与到这些研究中,一个人必须先同意进行一项 基因测试,比如,向苹果公司认可的实验室提交一个“唾液收集包”。最初的这种实验室据说是由加州大学和Mount Sinai医院运营的顶级 基因 中心。计划中的DNA研究,将收集 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 小旋风柴进 浏览:269 回复:0

安捷伦$8000万投资下一代测序公司

,该期权将于2018年3月2日到期。“安捷伦投资于具有广阔前景的 基因 团队和技术,”安捷伦诊断和基因组学集团总裁Jacob Thaysen在一份声明中说,“安捷伦一直很明确,关于其在诊断领域继续成长、并为此构建 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 青衫无名 浏览:84 回复:0

12小时上线“新冠肺炎同程查询工具”,开发者这样狙击疫情

看到了中国开发者的力量。童永鳌在办公 工具上线后,累计访问量已突破3500万次,并获得人民日报的点赞转发。做力所能及的小事,帮助大家共度难关阿里妹:能否简单介绍 病毒确诊患者同程查询工具的开发初衷?童永鳌:最开始的原因很单纯,就我自己有查询 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1947222060680488 浏览:69 回复:0

阿里巴巴火速开发新冠肺炎联防联控平台,浙江省卫健委率先启用

地市卫健委、90个区县卫健局、上千个基层防控工作小组。“疫情信息采集系统”界面不仅如此,面向公众的“新型肺炎防控公共服务管理平台”也已在支付宝和浙里办APP上线,公众可以在平台上查询自己是否曾与 肺炎病 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 云市场isv 浏览:214 回复:0

加速新冠疫苗研发,阿里云免费开放一切AI算力!

@alibaba-inc.com**目前,中国疾控中心已成功分离 病毒,疫苗研发和药物筛选仍在争分夺秒地进行。新药和疫苗研发期间,需要进行大量的数据分析、大规模文献筛选和科学超算工作。阿里云可以提供强大的AI算力,支持 病毒 基因 、新药研发、蛋白筛选等工作,帮助科研 ...
来自: 开发者社区 > 博客 作者: 1947222060680488 浏览:26 回复:0
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